Многочисленные и разнообразные месторождения связаны с массивами позднепалеозойских гранитоидов. В Южном Тянь-Шане это месторождения молибдена, вольфрама, магнетита, халькопирита, полиметаллов, меди и других полезных ископаемых. В Центральном Казахстане к гранитоидам Успенской зоны смятия приурочены месторождения полиметаллов. С 18-го века известны и разрабатываются полиметаллические месторождения Рудного Алтая, где выделяется несколько рудных поясов, приуроченных к определенным структурно-фациаль-ным зонам. В пределах каждого пояса расположены месторождения свинца, цинка, олова, меди, серебра, золота. На востоке Калба-Нарын-ской зоны известны месторождения вольфрама и олова, а на западе Калбы развиты золоторудный пояс и молибденовые и вольфрамовые месторождения. К северо-востоку от Рудного Алтая располагается Горноалтайский редкометальный пояс.
Кроме вышеуказанных известны и другие полезные ископаемые, связанные с магматическими и метаморфическими образованиями средне-позднепалеозойского возраста, причем, кроме рудных, среди них встречаются и нерудные полезные ископаемые.